La Junta Directiva es el órgano que toma las decisiones finales sobre las operaciones de la RTA. La junta, compuesta por 10 miembros, es nombrada por un período de tres años por los ejecutivos de los condados de Wayne, Oakland y Macomb, el presidente de la Junta de Comisionados del Condado de Washtenaw, el alcalde de Detroit y el gobernador de Michigan. La persona designada por el gobernador ejerce como presidente sin derecho a voto.